将不同时期的同一基因表达量进行比较,找出相同点与不同之处、变化的性质与量有何增减以及发展变化的速度,幅度和大小,数据出来了,结果也就出来了!
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如何比较多个基因的表达量__怎样检测actin基因在不同组织的表达量高低

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一、用什么方法检测一种基因在不同组织中的表达量

将不同时期的同一基因表达量进行比较,找出相同点与不同之处、变化的性质与量有何增减以及发展变化的速度,幅度和大小,数据出来了,结果也就出来了!

用什么方法检测一种基因在不同组织中的表达量


二、基因的表达丰度怎么理解

也就是基因的表达量是多少的意思,表达量就是基因经过转录翻译的次数.

基因的表达丰度怎么理解


三、怎么查找一个细胞系所有基因的表达

HeLa细胞通过关闭某些信号通路(包括PI3K和MKK4/MAPK信号通路),激活某些信号通路(包括cAMP、Ca~(2+)—CaM、PKC、Ras和P38/MAPK信号通路),激活或抑制不同的信号分子,使细胞产生具有针对性的细胞效应,包括诱导表达多种特异性蛋白(酶、细胞骨架蛋白、细胞因子等)、改变代谢途径、减弱某些代谢、加强另一些代谢以及提高胞内运输能力等,最终使自己可以适应痢疾杆菌的侵袭而生存下去。
为了鉴定在病原菌与寄主细胞相互作用中新的未知的EST序列,我们采用代表约4000个新基因的cDNA微阵列研究了痢疾杆菌入侵前和入侵后3h的人上皮细胞差异表达的新基因,结果共鉴定到≥3倍或≤0.33的差异表达的代表新基因的EST序列76条,然后这些EST序列采用Siclone软件分析,进行电子延伸,在BLAST比较分析之后,其中25个延伸序列鉴定为与重要的肠道功能相关的已知基因,包括痢疾杆菌-诱导的凋亡(TPPⅡ)、细胞骨架(如actin、talin、cofilin和gelsolin)、离子转运(calpain-5、Nedd4和Calcium-transporting ATPaseⅠ)、离子通道功能(如ABCA8、TPD52等)、粘膜屏障防御(CLECSF2)、异型生物质代谢以及上皮细胞的保护机制(vof-16)。
更为重要性的是,通过RT-PCR克隆并测序,经BLAST搜索,鉴定到3个显著差异的新的EST序列,并用荧光实时定量RT-PCR实验证实这三个新序列的确在痢疾杆菌侵袭期间高表达。
这三个基因是新的人基因或假基因,其相关信息已提交GeneBank,登录号为nos.AY776160,AY776161和AY776162。
我们认为它们在细胞对痢疾杆菌2457T侵袭反应中起重要的作用。
这些结果促进了对痢疾杆菌分子致病机理的认识,也为形成预防和治疗痢疾的策略提供了理论基础。

怎么查找一个细胞系所有基因的表达


四、怎样检测actin基因在不同组织的表达量高低

actin一般作为内参使用,意味着它的表达水平在多数细胞中是比较一致的。
如果需要比较actin的话,就需要使用其他的内参了,比如GAPDH。
具体选择什么基因作为内参,就和你选取的组织有关,最好查阅一下文献,然后多选择几个内参比较一下。

怎样检测actin基因在不同组织的表达量高低


五、如何判定基因的表达量高低

一个代表转录水平;
另一个代表翻译及其后的修饰水平。
因为两者不一定是平行的。
这也就是为什么基因组研究做过后,自然要向蛋白质组研究方向发展。
免疫组化可以用来进行定位,但是不能精确定量,而且有时会有假阳性,不易与背景区分;
Western blot可以特异性检测某个蛋白质分子,进行定量,但是不能定位。

如何判定基因的表达量高低


六、如何分析不同时期的同一基因表达量变化

将不同时期的同一基因表达量进行比较,找出相同点与不同之处、变化的性质与量有何增减以及发展变化的速度,幅度和大小,数据出来了,结果也就出来了!

如何分析不同时期的同一基因表达量变化


参考文档

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潘怡菁
发表于 2023-06-27 09:57

回复 叶纯:表达谱矩阵表达量计算:Ratio=(CH1I-CH1B)/(CH2I-CH2B)芯片数据格式 下列为表达谱矩阵的一般格式:每一列为一个样本(sample)的所有基因表达值,每一行为某个基因在所有样本的表达值 原始数据呈偏态分布对数转化后呈... [详细]